Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB3Q05901 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms