Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPCQ03188 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPCQ03188 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms