Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUCB1Q02818 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUCB1Q02818 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms