Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NHLH2Q02577 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms