Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALDH6A1Q02252 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALDH6A1Q02252 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms