Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MYBPC1Q00872 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYBPC1Q00872 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms