Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN2AP68543 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN2AP68543 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms