Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL23P62829 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL23P62829 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL23P62829 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL23P62829 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL23P62829 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL23P62829 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL23P62829 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL23P62829 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL23P62829 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL23P62829 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL23P62829 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL23P62829 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL23P62829 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL23P62829 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL23P62829 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL23P62829 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL23P62829 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL23P62829 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL23P62829 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL23P62829 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL23P62829 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL23P62829 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL23P62829 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL23P62829 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL23P62829 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL23P62829 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL23P62829 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL23P62829 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL23P62829 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL23P62829 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL23P62829 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL23P62829 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL23P62829 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL23P62829 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL23P62829 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL23P62829 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL23P62829 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL23P62829 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL23P62829 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL23P62829 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL23P62829 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL23P62829 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL23P62829 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL23P62829 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL23P62829 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL23P62829 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL23P62829 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL23P62829 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL23P62829 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL23P62829 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL23P62829 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL23P62829 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL23P62829 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL23P62829 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL23P62829 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL23P62829 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL23P62829 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL23P62829 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL23P62829 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL23P62829 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL23P62829 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL23P62829 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL23P62829 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL23P62829 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL23P62829 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL23P62829 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL23P62829 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL23P62829 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL23P62829 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL23P62829 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL23P62829 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL23P62829 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL23P62829 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL23P62829 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL23P62829 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL23P62829 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL23P62829 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL23P62829 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL23P62829 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL23P62829 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL23P62829 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL23P62829 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL23P62829 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL23P62829 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL23P62829 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL23P62829 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL23P62829 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL23P62829 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL23P62829 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL23P62829 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL23P62829 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL23P62829 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL23P62829 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL23P62829 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL23P62829 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL23P62829 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL23P62829 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPL23P62829 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPL23P62829 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms