Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP2S1P53680 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
AP2S1P53680 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP2S1P53680 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP2S1P53680 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP2S1P53680 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP2S1P53680 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP2S1P53680 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP2S1P53680 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP2S1P53680 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP2S1P53680 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms