Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPIAP49247 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPIAP49247 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPIAP49247 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPIAP49247 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RPIAP49247 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RPIAP49247 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPIAP49247 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPIAP49247 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPIAP49247 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPIAP49247 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPIAP49247 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPIAP49247 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPIAP49247 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPIAP49247 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPIAP49247 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPIAP49247 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPIAP49247 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPIAP49247 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPIAP49247 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPIAP49247 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPIAP49247 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPIAP49247 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPIAP49247 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPIAP49247 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPIAP49247 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPIAP49247 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPIAP49247 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPIAP49247 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPIAP49247 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPIAP49247 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPIAP49247 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPIAP49247 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPIAP49247 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPIAP49247 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPIAP49247 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPIAP49247 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPIAP49247 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPIAP49247 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPIAP49247 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPIAP49247 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPIAP49247 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RPIAP49247 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPIAP49247 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RPIAP49247 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPIAP49247 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPIAP49247 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPIAP49247 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPIAP49247 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPIAP49247 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPIAP49247 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPIAP49247 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPIAP49247 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPIAP49247 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPIAP49247 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPIAP49247 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPIAP49247 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPIAP49247 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPIAP49247 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPIAP49247 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPIAP49247 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPIAP49247 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPIAP49247 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPIAP49247 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPIAP49247 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPIAP49247 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPIAP49247 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPIAP49247 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPIAP49247 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPIAP49247 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPIAP49247 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPIAP49247 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPIAP49247 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPIAP49247 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPIAP49247 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPIAP49247 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPIAP49247 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPIAP49247 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPIAP49247 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPIAP49247 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPIAP49247 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPIAP49247 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPIAP49247 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPIAP49247 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPIAP49247 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPIAP49247 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPIAP49247 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPIAP49247 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPIAP49247 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPIAP49247 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPIAP49247 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPIAP49247 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPIAP49247 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPIAP49247 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPIAP49247 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPIAP49247 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPIAP49247 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPIAP49247 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPIAP49247 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPIAP49247 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms