Protein–RNA interactions for Protein: P46781

RPS9, 40S ribosomal protein S9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS9P46781 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS9P46781 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS9P46781 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS9P46781 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS9P46781 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS9P46781 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS9P46781 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS9P46781 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS9P46781 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS9P46781 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS9P46781 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS9P46781 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS9P46781 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS9P46781 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS9P46781 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS9P46781 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS9P46781 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS9P46781 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS9P46781 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS9P46781 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS9P46781 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS9P46781 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS9P46781 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS9P46781 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS9P46781 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS9P46781 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS9P46781 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS9P46781 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS9P46781 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS9P46781 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS9P46781 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS9P46781 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS9P46781 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS9P46781 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS9P46781 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS9P46781 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS9P46781 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS9P46781 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS9P46781 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS9P46781 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS9P46781 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS9P46781 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS9P46781 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS9P46781 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS9P46781 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS9P46781 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS9P46781 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS9P46781 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS9P46781 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS9P46781 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS9P46781 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS9P46781 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS9P46781 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS9P46781 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS9P46781 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS9P46781 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS9P46781 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS9P46781 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS9P46781 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS9P46781 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS9P46781 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS9P46781 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS9P46781 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS9P46781 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS9P46781 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS9P46781 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS9P46781 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS9P46781 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS9P46781 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS9P46781 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS9P46781 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS9P46781 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS9P46781 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS9P46781 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS9P46781 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS9P46781 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS9P46781 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS9P46781 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS9P46781 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS9P46781 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS9P46781 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS9P46781 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS9P46781 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS9P46781 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS9P46781 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS9P46781 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS9P46781 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS9P46781 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS9P46781 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS9P46781 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS9P46781 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS9P46781 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS9P46781 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS9P46781 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS9P46781 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS9P46781 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS9P46781 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS9P46781 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS9P46781 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS9P46781 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms