Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP2P42575 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP2P42575 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP2P42575 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP2P42575 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP2P42575 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP2P42575 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP2P42575 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP2P42575 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP2P42575 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP2P42575 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP2P42575 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP2P42575 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP2P42575 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP2P42575 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP2P42575 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP2P42575 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP2P42575 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP2P42575 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP2P42575 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP2P42575 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP2P42575 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP2P42575 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP2P42575 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP2P42575 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP2P42575 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP2P42575 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP2P42575 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP2P42575 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP2P42575 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP2P42575 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP2P42575 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP2P42575 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP2P42575 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP2P42575 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP2P42575 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP2P42575 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP2P42575 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP2P42575 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP2P42575 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP2P42575 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP2P42575 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP2P42575 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP2P42575 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP2P42575 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP2P42575 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP2P42575 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP2P42575 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP2P42575 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP2P42575 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP2P42575 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP2P42575 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP2P42575 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP2P42575 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP2P42575 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP2P42575 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CASP2P42575 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CASP2P42575 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CASP2P42575 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CASP2P42575 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CASP2P42575 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP2P42575 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP2P42575 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP2P42575 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP2P42575 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP2P42575 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP2P42575 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP2P42575 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP2P42575 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP2P42575 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP2P42575 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP2P42575 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP2P42575 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP2P42575 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP2P42575 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP2P42575 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP2P42575 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP2P42575 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP2P42575 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP2P42575 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP2P42575 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP2P42575 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP2P42575 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP2P42575 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP2P42575 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP2P42575 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP2P42575 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP2P42575 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP2P42575 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP2P42575 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP2P42575 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP2P42575 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP2P42575 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CASP2P42575 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP2P42575 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP2P42575 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP2P42575 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP2P42575 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP2P42575 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP2P42575 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms