Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PIK3CBP42338 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIK3CBP42338 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms