Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPHP41219 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPHP41219 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPHP41219 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPHP41219 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPHP41219 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPHP41219 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPHP41219 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPHP41219 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPHP41219 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPHP41219 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPHP41219 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPHP41219 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPHP41219 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPHP41219 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPHP41219 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPHP41219 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPHP41219 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPHP41219 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPHP41219 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPHP41219 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPHP41219 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPHP41219 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPHP41219 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPHP41219 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPHP41219 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPHP41219 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPHP41219 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPHP41219 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPHP41219 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPHP41219 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPHP41219 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPHP41219 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPHP41219 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPHP41219 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPHP41219 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPHP41219 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPHP41219 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPHP41219 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPHP41219 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPHP41219 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPHP41219 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPHP41219 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPHP41219 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPHP41219 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPHP41219 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPHP41219 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPHP41219 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPHP41219 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPHP41219 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPHP41219 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPHP41219 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPHP41219 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPHP41219 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPHP41219 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPHP41219 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPHP41219 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPHP41219 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPHP41219 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPHP41219 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPHP41219 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPHP41219 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPHP41219 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPHP41219 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPHP41219 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPHP41219 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPHP41219 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPHP41219 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPHP41219 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPHP41219 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPHP41219 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPHP41219 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPHP41219 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPHP41219 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPHP41219 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPHP41219 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPHP41219 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPHP41219 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPHP41219 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPHP41219 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPHP41219 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPHP41219 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPHP41219 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPHP41219 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPHP41219 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPHP41219 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPHP41219 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPHP41219 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPHP41219 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPHP41219 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPHP41219 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPHP41219 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPHP41219 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPHP41219 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPHP41219 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPHP41219 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPHP41219 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPHP41219 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPHP41219 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPHP41219 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms