Protein–RNA interactions for Protein: P40305

IFI27, Interferon alpha-inducible protein 27, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI27P40305 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFI27P40305 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFI27P40305 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFI27P40305 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFI27P40305 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFI27P40305 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
IFI27P40305 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFI27P40305 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFI27P40305 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IFI27P40305 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFI27P40305 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFI27P40305 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFI27P40305 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFI27P40305 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFI27P40305 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFI27P40305 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFI27P40305 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFI27P40305 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFI27P40305 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFI27P40305 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFI27P40305 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI27P40305 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI27P40305 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI27P40305 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI27P40305 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI27P40305 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI27P40305 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI27P40305 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI27P40305 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI27P40305 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI27P40305 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI27P40305 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI27P40305 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI27P40305 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI27P40305 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI27P40305 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI27P40305 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI27P40305 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI27P40305 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI27P40305 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI27P40305 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFI27P40305 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI27P40305 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI27P40305 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI27P40305 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI27P40305 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI27P40305 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI27P40305 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI27P40305 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI27P40305 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFI27P40305 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI27P40305 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI27P40305 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI27P40305 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI27P40305 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI27P40305 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI27P40305 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI27P40305 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI27P40305 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI27P40305 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI27P40305 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI27P40305 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI27P40305 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFI27P40305 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFI27P40305 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFI27P40305 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFI27P40305 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFI27P40305 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFI27P40305 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFI27P40305 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFI27P40305 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFI27P40305 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFI27P40305 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFI27P40305 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFI27P40305 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFI27P40305 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFI27P40305 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFI27P40305 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFI27P40305 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFI27P40305 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFI27P40305 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFI27P40305 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFI27P40305 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFI27P40305 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFI27P40305 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFI27P40305 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFI27P40305 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFI27P40305 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFI27P40305 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFI27P40305 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFI27P40305 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFI27P40305 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFI27P40305 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFI27P40305 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFI27P40305 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFI27P40305 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFI27P40305 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IFI27P40305 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFI27P40305 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFI27P40305 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms