Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HOXA7P31268 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms