Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD40LGP29965 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms