Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2E2P29084 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms