Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX2P28328 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX2P28328 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX2P28328 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX2P28328 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX2P28328 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX2P28328 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX2P28328 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX2P28328 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX2P28328 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX2P28328 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX2P28328 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX2P28328 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX2P28328 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX2P28328 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX2P28328 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX2P28328 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX2P28328 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX2P28328 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX2P28328 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX2P28328 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX2P28328 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX2P28328 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX2P28328 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX2P28328 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX2P28328 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX2P28328 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX2P28328 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX2P28328 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX2P28328 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PEX2P28328 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX2P28328 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX2P28328 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX2P28328 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX2P28328 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX2P28328 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX2P28328 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX2P28328 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX2P28328 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX2P28328 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX2P28328 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX2P28328 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX2P28328 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX2P28328 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX2P28328 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX2P28328 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX2P28328 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX2P28328 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX2P28328 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX2P28328 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX2P28328 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX2P28328 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX2P28328 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX2P28328 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PEX2P28328 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PEX2P28328 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PEX2P28328 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PEX2P28328 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PEX2P28328 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PEX2P28328 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PEX2P28328 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PEX2P28328 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PEX2P28328 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PEX2P28328 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PEX2P28328 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX2P28328 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX2P28328 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX2P28328 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX2P28328 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX2P28328 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX2P28328 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX2P28328 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX2P28328 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX2P28328 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX2P28328 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX2P28328 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX2P28328 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX2P28328 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX2P28328 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX2P28328 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX2P28328 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX2P28328 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX2P28328 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX2P28328 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX2P28328 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX2P28328 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX2P28328 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX2P28328 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX2P28328 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX2P28328 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX2P28328 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX2P28328 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX2P28328 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX2P28328 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX2P28328 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX2P28328 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX2P28328 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX2P28328 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX2P28328 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX2P28328 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms