Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTX3P26022 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTX3P26022 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTX3P26022 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTX3P26022 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTX3P26022 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTX3P26022 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTX3P26022 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTX3P26022 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTX3P26022 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTX3P26022 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTX3P26022 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTX3P26022 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTX3P26022 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTX3P26022 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTX3P26022 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTX3P26022 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTX3P26022 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTX3P26022 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTX3P26022 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTX3P26022 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTX3P26022 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PTX3P26022 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTX3P26022 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PTX3P26022 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTX3P26022 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTX3P26022 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTX3P26022 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTX3P26022 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTX3P26022 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTX3P26022 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTX3P26022 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTX3P26022 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTX3P26022 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTX3P26022 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTX3P26022 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTX3P26022 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTX3P26022 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTX3P26022 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTX3P26022 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTX3P26022 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTX3P26022 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTX3P26022 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTX3P26022 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTX3P26022 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTX3P26022 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTX3P26022 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTX3P26022 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTX3P26022 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTX3P26022 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTX3P26022 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTX3P26022 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTX3P26022 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTX3P26022 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTX3P26022 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTX3P26022 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTX3P26022 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTX3P26022 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTX3P26022 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTX3P26022 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTX3P26022 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTX3P26022 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTX3P26022 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTX3P26022 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTX3P26022 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTX3P26022 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTX3P26022 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTX3P26022 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTX3P26022 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTX3P26022 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTX3P26022 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTX3P26022 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTX3P26022 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTX3P26022 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTX3P26022 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTX3P26022 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTX3P26022 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTX3P26022 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTX3P26022 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTX3P26022 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTX3P26022 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTX3P26022 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTX3P26022 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTX3P26022 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTX3P26022 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTX3P26022 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTX3P26022 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTX3P26022 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTX3P26022 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTX3P26022 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTX3P26022 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTX3P26022 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTX3P26022 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTX3P26022 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTX3P26022 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTX3P26022 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTX3P26022 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTX3P26022 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTX3P26022 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTX3P26022 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms