Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
YY1P25490 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
YY1P25490 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
YY1P25490 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
YY1P25490 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
YY1P25490 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
YY1P25490 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
YY1P25490 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
YY1P25490 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
YY1P25490 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
YY1P25490 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
YY1P25490 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
YY1P25490 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
YY1P25490 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
YY1P25490 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
YY1P25490 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
YY1P25490 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
YY1P25490 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
YY1P25490 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
YY1P25490 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
YY1P25490 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
YY1P25490 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
YY1P25490 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
YY1P25490 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
YY1P25490 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
YY1P25490 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
YY1P25490 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
YY1P25490 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
YY1P25490 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
YY1P25490 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
YY1P25490 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
YY1P25490 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
YY1P25490 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
YY1P25490 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
YY1P25490 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
YY1P25490 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
YY1P25490 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
YY1P25490 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
YY1P25490 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
YY1P25490 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
YY1P25490 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
YY1P25490 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
YY1P25490 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
YY1P25490 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
YY1P25490 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
YY1P25490 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
YY1P25490 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
YY1P25490 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
YY1P25490 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
YY1P25490 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
YY1P25490 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
YY1P25490 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
YY1P25490 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
YY1P25490 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
YY1P25490 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
YY1P25490 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
YY1P25490 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
YY1P25490 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
YY1P25490 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
YY1P25490 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
YY1P25490 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
YY1P25490 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
YY1P25490 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
YY1P25490 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
YY1P25490 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
YY1P25490 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
YY1P25490 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
YY1P25490 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
YY1P25490 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
YY1P25490 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
YY1P25490 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
YY1P25490 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
YY1P25490 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
YY1P25490 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
YY1P25490 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
YY1P25490 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
YY1P25490 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
YY1P25490 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
YY1P25490 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
YY1P25490 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
YY1P25490 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
YY1P25490 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
YY1P25490 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
YY1P25490 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
YY1P25490 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
YY1P25490 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
YY1P25490 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
YY1P25490 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
YY1P25490 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
YY1P25490 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
YY1P25490 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
YY1P25490 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
YY1P25490 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
YY1P25490 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
YY1P25490 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
YY1P25490 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
YY1P25490 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
YY1P25490 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
YY1P25490 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
YY1P25490 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms