Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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