Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH1P12830 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH1P12830 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH1P12830 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH1P12830 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH1P12830 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH1P12830 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH1P12830 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH1P12830 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH1P12830 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH1P12830 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH1P12830 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH1P12830 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH1P12830 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH1P12830 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH1P12830 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH1P12830 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH1P12830 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH1P12830 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH1P12830 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH1P12830 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH1P12830 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH1P12830 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH1P12830 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH1P12830 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH1P12830 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH1P12830 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH1P12830 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH1P12830 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH1P12830 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH1P12830 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH1P12830 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH1P12830 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH1P12830 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH1P12830 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH1P12830 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH1P12830 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH1P12830 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH1P12830 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH1P12830 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH1P12830 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH1P12830 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH1P12830 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH1P12830 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH1P12830 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH1P12830 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH1P12830 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH1P12830 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH1P12830 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH1P12830 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH1P12830 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH1P12830 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH1P12830 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH1P12830 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH1P12830 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH1P12830 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH1P12830 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH1P12830 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH1P12830 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH1P12830 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH1P12830 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH1P12830 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH1P12830 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH1P12830 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH1P12830 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH1P12830 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH1P12830 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH1P12830 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH1P12830 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH1P12830 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH1P12830 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH1P12830 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH1P12830 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH1P12830 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH1P12830 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH1P12830 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH1P12830 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH1P12830 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH1P12830 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH1P12830 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH1P12830 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH1P12830 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH1P12830 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH1P12830 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH1P12830 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH1P12830 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH1P12830 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH1P12830 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH1P12830 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH1P12830 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH1P12830 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH1P12830 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH1P12830 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH1P12830 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH1P12830 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH1P12830 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH1P12830 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH1P12830 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH1P12830 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH1P12830 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms