Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms