Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP3P08254 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP3P08254 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP3P08254 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP3P08254 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP3P08254 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP3P08254 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP3P08254 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP3P08254 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP3P08254 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP3P08254 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP3P08254 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP3P08254 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP3P08254 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP3P08254 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP3P08254 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP3P08254 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP3P08254 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MMP3P08254 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MMP3P08254 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MMP3P08254 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MMP3P08254 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MMP3P08254 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MMP3P08254 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP3P08254 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP3P08254 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP3P08254 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP3P08254 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP3P08254 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP3P08254 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP3P08254 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP3P08254 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP3P08254 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP3P08254 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP3P08254 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP3P08254 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP3P08254 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP3P08254 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP3P08254 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP3P08254 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP3P08254 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP3P08254 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP3P08254 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP3P08254 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP3P08254 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP3P08254 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP3P08254 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP3P08254 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP3P08254 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP3P08254 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP3P08254 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP3P08254 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP3P08254 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP3P08254 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP3P08254 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP3P08254 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP3P08254 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP3P08254 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP3P08254 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP3P08254 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP3P08254 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP3P08254 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP3P08254 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP3P08254 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP3P08254 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP3P08254 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP3P08254 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP3P08254 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP3P08254 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP3P08254 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP3P08254 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP3P08254 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP3P08254 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP3P08254 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP3P08254 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP3P08254 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP3P08254 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP3P08254 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP3P08254 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP3P08254 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP3P08254 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP3P08254 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MMP3P08254 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP3P08254 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP3P08254 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP3P08254 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP3P08254 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP3P08254 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP3P08254 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP3P08254 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP3P08254 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP3P08254 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP3P08254 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP3P08254 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP3P08254 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP3P08254 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP3P08254 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP3P08254 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP3P08254 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP3P08254 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms