Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRKCGP05129 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms