Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPN1P04843 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPN1P04843 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPN1P04843 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPN1P04843 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPN1P04843 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPN1P04843 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPN1P04843 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPN1P04843 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPN1P04843 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPN1P04843 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPN1P04843 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RPN1P04843 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPN1P04843 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPN1P04843 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPN1P04843 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPN1P04843 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPN1P04843 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPN1P04843 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPN1P04843 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPN1P04843 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPN1P04843 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPN1P04843 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPN1P04843 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPN1P04843 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPN1P04843 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPN1P04843 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPN1P04843 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RPN1P04843 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPN1P04843 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPN1P04843 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPN1P04843 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPN1P04843 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPN1P04843 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPN1P04843 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPN1P04843 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPN1P04843 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPN1P04843 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPN1P04843 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPN1P04843 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPN1P04843 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPN1P04843 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPN1P04843 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPN1P04843 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPN1P04843 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPN1P04843 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPN1P04843 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPN1P04843 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPN1P04843 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPN1P04843 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RPN1P04843 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPN1P04843 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPN1P04843 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPN1P04843 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPN1P04843 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPN1P04843 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPN1P04843 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPN1P04843 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPN1P04843 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPN1P04843 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPN1P04843 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPN1P04843 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPN1P04843 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPN1P04843 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RPN1P04843 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPN1P04843 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPN1P04843 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPN1P04843 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPN1P04843 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPN1P04843 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPN1P04843 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPN1P04843 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPN1P04843 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPN1P04843 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPN1P04843 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPN1P04843 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPN1P04843 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPN1P04843 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPN1P04843 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPN1P04843 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPN1P04843 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPN1P04843 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPN1P04843 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPN1P04843 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPN1P04843 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPN1P04843 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPN1P04843 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPN1P04843 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPN1P04843 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPN1P04843 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPN1P04843 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPN1P04843 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RPN1P04843 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPN1P04843 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPN1P04843 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPN1P04843 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPN1P04843 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPN1P04843 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPN1P04843 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPN1P04843 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms