Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CYBBP04839 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYBBP04839 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYBBP04839 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYBBP04839 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYBBP04839 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYBBP04839 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYBBP04839 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYBBP04839 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYBBP04839 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYBBP04839 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYBBP04839 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYBBP04839 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYBBP04839 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYBBP04839 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYBBP04839 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYBBP04839 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYBBP04839 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYBBP04839 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYBBP04839 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CYBBP04839 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYBBP04839 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYBBP04839 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CYBBP04839 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYBBP04839 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYBBP04839 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYBBP04839 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYBBP04839 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYBBP04839 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYBBP04839 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYBBP04839 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYBBP04839 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYBBP04839 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYBBP04839 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYBBP04839 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYBBP04839 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYBBP04839 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYBBP04839 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYBBP04839 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYBBP04839 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYBBP04839 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYBBP04839 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYBBP04839 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYBBP04839 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYBBP04839 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYBBP04839 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYBBP04839 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYBBP04839 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYBBP04839 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYBBP04839 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CYBBP04839 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYBBP04839 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYBBP04839 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYBBP04839 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYBBP04839 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYBBP04839 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYBBP04839 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYBBP04839 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CYBBP04839 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYBBP04839 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYBBP04839 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYBBP04839 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYBBP04839 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYBBP04839 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYBBP04839 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYBBP04839 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYBBP04839 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYBBP04839 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYBBP04839 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYBBP04839 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYBBP04839 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYBBP04839 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYBBP04839 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYBBP04839 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYBBP04839 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYBBP04839 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYBBP04839 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYBBP04839 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYBBP04839 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYBBP04839 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYBBP04839 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYBBP04839 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYBBP04839 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYBBP04839 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYBBP04839 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYBBP04839 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CYBBP04839 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYBBP04839 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYBBP04839 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYBBP04839 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYBBP04839 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYBBP04839 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYBBP04839 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYBBP04839 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYBBP04839 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYBBP04839 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYBBP04839 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYBBP04839 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYBBP04839 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYBBP04839 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms