Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A1P02730 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A1P02730 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A1P02730 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A1P02730 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A1P02730 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A1P02730 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A1P02730 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A1P02730 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A1P02730 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A1P02730 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A1P02730 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A1P02730 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A1P02730 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A1P02730 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A1P02730 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A1P02730 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A1P02730 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A1P02730 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A1P02730 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A1P02730 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A1P02730 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A1P02730 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A1P02730 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A1P02730 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A1P02730 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A1P02730 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A1P02730 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A1P02730 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms