Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-7P01780 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHV3-7P01780 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHV3-7P01780 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHV3-7P01780 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-7P01780 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-7P01780 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-7P01780 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-7P01780 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-7P01780 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-7P01780 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-7P01780 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-7P01780 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-7P01780 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-7P01780 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-7P01780 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-7P01780 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-7P01780 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-7P01780 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-7P01780 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-7P01780 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-7P01780 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-7P01780 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-7P01780 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-7P01780 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-7P01780 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-7P01780 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-7P01780 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-7P01780 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms