Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms