Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH16O75309 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH16O75309 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH16O75309 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH16O75309 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH16O75309 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH16O75309 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH16O75309 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH16O75309 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH16O75309 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH16O75309 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH16O75309 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH16O75309 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH16O75309 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH16O75309 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH16O75309 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH16O75309 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH16O75309 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH16O75309 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDH16O75309 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDH16O75309 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH16O75309 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH16O75309 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH16O75309 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH16O75309 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH16O75309 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH16O75309 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH16O75309 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH16O75309 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH16O75309 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH16O75309 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH16O75309 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH16O75309 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH16O75309 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH16O75309 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH16O75309 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH16O75309 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH16O75309 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH16O75309 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH16O75309 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH16O75309 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH16O75309 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH16O75309 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH16O75309 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH16O75309 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH16O75309 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH16O75309 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH16O75309 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH16O75309 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDH16O75309 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDH16O75309 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH16O75309 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH16O75309 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH16O75309 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH16O75309 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH16O75309 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH16O75309 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH16O75309 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH16O75309 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH16O75309 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH16O75309 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH16O75309 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH16O75309 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH16O75309 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH16O75309 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH16O75309 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH16O75309 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH16O75309 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH16O75309 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH16O75309 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH16O75309 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH16O75309 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH16O75309 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH16O75309 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH16O75309 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH16O75309 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH16O75309 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH16O75309 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH16O75309 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH16O75309 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH16O75309 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH16O75309 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH16O75309 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH16O75309 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH16O75309 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH16O75309 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH16O75309 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH16O75309 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH16O75309 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH16O75309 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH16O75309 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH16O75309 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH16O75309 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH16O75309 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH16O75309 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH16O75309 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH16O75309 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH16O75309 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH16O75309 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH16O75309 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193 ms