Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
PPLO60437 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PPLO60437 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PPLO60437 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PPLO60437 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PPLO60437 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PPLO60437 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PPLO60437 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
PPLO60437 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PPLO60437 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PPLO60437 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
PPLO60437 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PPLO60437 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PPLO60437 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PPLO60437 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PPLO60437 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PPLO60437 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PPLO60437 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PPLO60437 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PPLO60437 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PPLO60437 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PPLO60437 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PPLO60437 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
PPLO60437 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PPLO60437 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PPLO60437 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PPLO60437 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PPLO60437 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PPLO60437 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PPLO60437 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
PPLO60437 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PPLO60437 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PPLO60437 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PPLO60437 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PPLO60437 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PPLO60437 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PPLO60437 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PPLO60437 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PPLO60437 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PPLO60437 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
PPLO60437 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PPLO60437 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PPLO60437 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PPLO60437 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PPLO60437 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
PPLO60437 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PPLO60437 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PPLO60437 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PPLO60437 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PPLO60437 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PPLO60437 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
PPLO60437 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PPLO60437 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PPLO60437 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PPLO60437 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PPLO60437 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PPLO60437 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PPLO60437 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PPLO60437 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
PPLO60437 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PPLO60437 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PPLO60437 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PPLO60437 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PPLO60437 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PPLO60437 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PPLO60437 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
PPLO60437 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PPLO60437 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PPLO60437 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PPLO60437 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
PPLO60437 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PPLO60437 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PPLO60437 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PPLO60437 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PPLO60437 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PPLO60437 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PPLO60437 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PPLO60437 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PPLO60437 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PPLO60437 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PPLO60437 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PPLO60437 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PPLO60437 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PPLO60437 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PPLO60437 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PPLO60437 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PPLO60437 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PPLO60437 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PPLO60437 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PPLO60437 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PPLO60437 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PPLO60437 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PPLO60437 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PPLO60437 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PPLO60437 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PPLO60437 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PPLO60437 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PPLO60437 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
PPLO60437 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PPLO60437 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms