Protein–RNA interactions for Protein: O43934

MFSD11, UNC93-like protein MFSD11, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD11O43934 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MFSD11O43934 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MFSD11O43934 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms