Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LANCL1O43813 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LANCL1O43813 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LANCL1O43813 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LANCL1O43813 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LANCL1O43813 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LANCL1O43813 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LANCL1O43813 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LANCL1O43813 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LANCL1O43813 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LANCL1O43813 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LANCL1O43813 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LANCL1O43813 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LANCL1O43813 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LANCL1O43813 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LANCL1O43813 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LANCL1O43813 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LANCL1O43813 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LANCL1O43813 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LANCL1O43813 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LANCL1O43813 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LANCL1O43813 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LANCL1O43813 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LANCL1O43813 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LANCL1O43813 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LANCL1O43813 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LANCL1O43813 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LANCL1O43813 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms