Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUPL2O15504 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUPL2O15504 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUPL2O15504 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUPL2O15504 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUPL2O15504 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUPL2O15504 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUPL2O15504 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUPL2O15504 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUPL2O15504 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUPL2O15504 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUPL2O15504 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUPL2O15504 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUPL2O15504 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUPL2O15504 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUPL2O15504 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUPL2O15504 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUPL2O15504 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUPL2O15504 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUPL2O15504 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUPL2O15504 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUPL2O15504 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms