Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHUKO15111 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHUKO15111 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHUKO15111 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHUKO15111 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHUKO15111 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHUKO15111 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHUKO15111 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHUKO15111 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHUKO15111 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHUKO15111 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHUKO15111 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHUKO15111 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHUKO15111 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHUKO15111 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHUKO15111 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHUKO15111 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHUKO15111 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHUKO15111 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHUKO15111 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHUKO15111 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHUKO15111 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHUKO15111 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHUKO15111 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHUKO15111 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHUKO15111 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHUKO15111 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHUKO15111 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHUKO15111 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHUKO15111 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHUKO15111 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHUKO15111 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHUKO15111 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHUKO15111 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHUKO15111 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHUKO15111 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHUKO15111 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHUKO15111 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHUKO15111 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHUKO15111 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHUKO15111 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHUKO15111 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHUKO15111 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHUKO15111 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHUKO15111 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHUKO15111 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHUKO15111 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHUKO15111 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHUKO15111 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHUKO15111 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHUKO15111 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHUKO15111 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHUKO15111 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHUKO15111 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHUKO15111 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHUKO15111 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHUKO15111 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHUKO15111 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHUKO15111 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHUKO15111 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHUKO15111 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHUKO15111 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHUKO15111 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHUKO15111 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHUKO15111 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHUKO15111 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHUKO15111 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHUKO15111 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHUKO15111 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHUKO15111 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHUKO15111 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHUKO15111 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHUKO15111 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHUKO15111 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHUKO15111 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHUKO15111 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHUKO15111 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHUKO15111 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHUKO15111 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHUKO15111 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHUKO15111 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHUKO15111 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHUKO15111 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHUKO15111 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHUKO15111 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHUKO15111 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHUKO15111 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHUKO15111 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHUKO15111 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHUKO15111 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHUKO15111 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHUKO15111 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHUKO15111 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHUKO15111 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHUKO15111 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHUKO15111 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHUKO15111 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHUKO15111 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHUKO15111 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHUKO15111 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms