Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms