Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PP2D1A8MPX8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms