Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP27XA6NNY8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms