Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRRM3A6NNA2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms