Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM23A6NLE4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM23A6NLE4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms