Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
RGPD3A6NKT7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD3A6NKT7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms