Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC66A2RUB6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC66A2RUB6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC66A2RUB6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms