Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms