Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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PTPRJQ12913 TMUB2-203ENST00000446571 1580 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 METTL4-203ENST00000574538 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 GEMIN8-202ENST00000380523 1682 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AC011525.2-202ENST00000590611 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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PTPRJQ12913 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 LIMK1-201ENST00000336180 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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PTPRJQ12913 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 CCNG1-201ENST00000340828 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 ALDH3B2-204ENST00000530069 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 IST1-221ENST00000544564 1500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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PTPRJQ12913 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 FAM95C-205ENST00000637556 2421 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 PCDHA10-202ENST00000506939 3788 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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PTPRJQ12913 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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PTPRJQ12913 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 DCUN1D3-202ENST00000563934 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 CNTF-201ENST00000361987 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 SALL4P1-201ENST00000510352 1860 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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PTPRJQ12913 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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PTPRJQ12913 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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PTPRJQ12913 AL139807.1-201ENST00000500636 704 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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PTPRJQ12913 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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PTPRJQ12913 AC068234.1-201ENST00000560629 2785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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PTPRJQ12913 AOX3P-202ENST00000469595 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 PRPF4-202ENST00000374199 3212 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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PTPRJQ12913 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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PTPRJQ12913 AL356583.1-201ENST00000398739 1371 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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PTPRJQ12913 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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