Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 RBMY2FP-201ENST00000303922 2042 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 PAX3-202ENST00000336840 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 WDSUB1-204ENST00000409124 1600 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AC078850.1-201ENST00000514265 1623 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 PITX2-212ENST00000614423 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AC122688.3-201ENST00000623804 3467 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 PAX6-255ENST00000639386 1723 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 IGHG2-202ENST00000641095 2594 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AL121772.1-201ENST00000618303 2335 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 GTF2IP20-203ENST00000634905 2966 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 MBP-207ENST00000397865 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AC026904.1-201ENST00000430626 3549 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 GSTM2P1-201ENST00000405166 654 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AC007312.1-201ENST00000427493 258 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 IGHV3-6-201ENST00000518407 347 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 SNORD55-201ENST00000581525 80 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AL109618.3-201ENST00000622748 430 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AC138430.2-201ENST00000624068 504 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 ITIH5-201ENST00000397145 3132 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 ANKMY1-201ENST00000272972 3228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AC011511.5-201ENST00000589379 3219 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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PTPRJQ12913 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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PTPRJQ12913 RPL13AP17-204ENST00000450028 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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PTPRJQ12913 COX4I2-201ENST00000376075 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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PTPRJQ12913 AL138885.2-201ENST00000420389 539 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 PGC-204ENST00000425343 1152 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 RN7SL47P-201ENST00000488710 299 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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