Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AC079601.2-201ENST00000547729 775 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 DEGS2-202ENST00000553834 421 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 MIR4688-201ENST00000577966 83 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 RN7SL341P-201ENST00000613745 298 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 GGPS1-202ENST00000358966 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 ACAA2-205ENST00000587994 1657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 PCTP-202ENST00000325214 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 PEX11B-203ENST00000537888 1632 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 PTCD2-212ENST00000543322 2029 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 PMS1-204ENST00000409823 2795 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 DDX56-204ENST00000431640 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 AL353759.1-201ENST00000635439 1578 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 CLCN6-206ENST00000376496 2922 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 ITPRIP-202ENST00000337478 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 DEDD-203ENST00000458050 2300 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 NONO-203ENST00000373856 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 XAB2-201ENST00000358368 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 MKX-202ENST00000419761 3638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 LINC01106-201ENST00000436665 2244 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 TSC22D3-206ENST00000372397 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 UGT1A4-201ENST00000373409 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 UGT1A3-201ENST00000482026 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 PADI6-201ENST00000619609 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 CD33-202ENST00000391796 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 PRR13-202ENST00000429243 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 AL354733.3-201ENST00000448389 390 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 AP001922.5-201ENST00000527803 651 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 MARVELD3-205ENST00000567501 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 AL589743.3-201ENST00000604121 517 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 LINC01206-212ENST00000609168 988 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 FP671120.4-201ENST00000629969 923 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 TSPYL2-201ENST00000375442 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 ZNF101-203ENST00000415784 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 PAX9-202ENST00000402703 3104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 AC015959.1-201ENST00000623263 1377 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 GOLGA8Q-201ENST00000562783 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 RNF13-201ENST00000344229 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 MRGPRX2-201ENST00000329773 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 ZNF583-201ENST00000291598 2538 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 ALG8-201ENST00000299626 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 EEF1AKMT3-202ENST00000333012 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 ARHGAP33-203ENST00000314737 3858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 SNCG-202ENST00000372017 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 AC099681.2-201ENST00000449899 543 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 RPL3P9-201ENST00000463217 1183 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.3 ms