Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GTF3C3Q9Y5Q9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GTF3C3Q9Y5Q9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GTF3C3Q9Y5Q9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms