Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3IP3Q9Y228 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3IP3Q9Y228 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3IP3Q9Y228 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3IP3Q9Y228 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3IP3Q9Y228 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3IP3Q9Y228 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3IP3Q9Y228 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3IP3Q9Y228 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3IP3Q9Y228 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3IP3Q9Y228 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3IP3Q9Y228 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3IP3Q9Y228 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3IP3Q9Y228 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3IP3Q9Y228 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3IP3Q9Y228 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3IP3Q9Y228 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAF3IP3Q9Y228 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3IP3Q9Y228 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms